Die meisten Besuche beginnen in der Kleinen Festung, die zwischen 1940 und 1945 von der Gestapo (Geheimpolizei der Nazis) als Gefängnis genutzt wurde. Sie werden durch bewachte Tore in Gefängnishöfe, Sammelzellen, Zimmer für Einzelhaft, Verhörräume und Hinrichtungsstätten geführt. Die erhaltene Anlage zeigt die harten Haftbedingungen, denen politische Gefangene, Widerstandskämpfer und Juden vor ihrer Deportation oder Hinrichtung ausgesetzt waren.

Im Inneren der Kleinen Festung veranschaulichen offene Höfe, Strafzellen und Galgen die systematische Brutalität der Nazi-Gefangenschaft. Informationstafeln und persönliche Aufzeichnungen dokumentieren Überbelegung, Zwangsarbeit, Krankheit und Folter. Diese Räume sind weitgehend unverändert geblieben und verdeutlichen das Ausmaß des Leids, das Tausende von Menschen hier unter der Aufsicht der Gestapo ertragen mussten.

Das Ghettomuseum befindet sich in der ehemaligen Stadtschule und dokumentiert das jüdische Leben im Theresienstädter Ghetto. Zu den Exponaten gehören Fotos, Transportlisten, persönliche Gegenstände, Tagebücher und offizielle NS-Befehle. Ein wichtiger Schwerpunkt ist das tägliche Überleben: Wohnungsnot, Hunger, Zwangsarbeit und die Rolle des Lagers als Durchgangsstation zu den Vernichtungslagern.

Einer der bewegendsten Abschnitte zeigt Zeichnungen, Gedichte und Notizbücher von Kindern, die in Theresienstadt entstanden sind. Über 4.000 Werke sind heute noch erhalten, von denen viele hier ausgestellt sind. Sie zeigen, wie Bildung, Kunst, Musik und Theater zu einem Akt des kulturellen Widerstands wurden und Kindern trotz Deportation und fast sicherem Tod eine emotionale Zuflucht boten.

Der Besuch endet am Krematorium und den umliegenden Gedenkstätten. Dieser Bereich erklärt, wie mit den Leichen umgegangen wurde und erinnert an die Opfer, die an Hunger, Krankheit oder Hinrichtung starben. Gedenktafeln, Massengräber und Zeremonienhallen bieten Raum zum Nachdenken und stellen das Gedenken über das Spektakel.

Das Kolumbarium befand sich in der Nähe des Krematoriums und enthielt Urnen mit der Asche von Häftlingen, die in Theresienstadt gestorben waren. 1944 ordneten die Nazis an, die Urnen zu vernichten, um die Beweise für den Massentod zu beseitigen. Der Ort steht nun als Mahnmal und symbolisiert sowohl die systematische Ermordung als auch den absichtlichen Versuch, die Identität der Opfer zu löschen.

Auf dem Zentralfriedhof befinden sich Massengräber von Gefangenen, die an Hunger, Krankheiten und Erschöpfung gestorben sind. Gedenksteine ehren Opfer verschiedener Nationalitäten und Glaubensrichtungen. Dieser offene, feierliche Raum unterstreicht das Ausmaß des Todes in Theresienstadt und dient als letzter Punkt des Gedenkens auf dem Gelände der Gedenkstätte.

Obwohl die Züge vom nahe gelegenen Bahnhof Bohušovice abfuhren, erklären Ausstellungen in Theresienstadt den Deportationsprozess im Detail. Transportlisten, Zeitpläne und Berichte von Überlebenden dokumentieren, wie die meisten Häftlinge nach Auschwitz und in andere Vernichtungslager weitergeschickt wurden, was die Rolle von Theresienstadt als Durchgangslager und nicht als Endstation unterstreicht.